В основе дифференцировки мозга (cephalon) на отделы, как и у всех амниот, видимо, лежат его первичные функциональные связи с органами чувств (Дзержинский, 1998). Конечный мозг (telencephalon) снабжен парными полушариями с боковыми желудочками (ventriculus lateralis), в каждый из которых впадает межжелудочное отверстие (foramen interverticulare). Тонкая крыша конечного мозга образует переднее сосудистое сплетение (plexus chorioideus anterior). Полушария (hemispherae) переднего мозга (telencephalon) образуют дорсально тонкий плащ (pallium), а вентрально – утолщенное полосатое тело (corpus striatum). Плащ разделяется на две части: старая кора (archipallium) и древняя кора (paleopallium). Оба полушария соединены друг с другом при помощи комиссур (поперечных пучков), расположенных в концевой пластинке.

Промежуточный мозг (diencephalon) состоит из четырех отделов: эпиталамус (epythalamus), дорсальный таламус (thalamus dorsalis), вентральный таламус (thalamus ventralis) и гипоталамус (hypothalamus). В промежуточном мозге третий желудочек (ventriculus III) сдавлен с боков буграми (thalamus). Выше расположено парное ядро уздечки (ganglion habenulae). Гипоталамус включает перекрест второго нерва (chiasma opticum), воронку (infundibulum). К воронке примыкает гипофиз (hypophysis).

Средний мозг (mesencephalon) заключает в себе зрительный желудочек (ventriculus opticus= aqueductus cerebri), прикрытый сверху зрительной крышей (tectum opticum). Зрительная кора – важный общий координационный центр, в котором находятся почти все волокна зрительного нерва и другие сенсорные волокна (кроме обонятельных).

Крыша продолговатого мозга (myelencephalon) образует заднее сосудистое сплетение (plexus chorioideus posterior), прикрывающее полость этого отдела, называемую четвертым желудочком, или ромбовидной ямкой (ventriculus IV = fossa rhomboidea). Продолговатый мозг образует в вертикальной плоскости ясный изгиб, что характерно для всех высших позвоночных.

Мозжечок (cerebellum) полый, развит слабо, но сильнее, чем у амфибий.